MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 49727

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020537	TAT	2	6	641	646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198177
2	NC_020537	CAA	2	6	679	684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470198177
3	NC_020537	TGT	2	6	717	722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470198177
4	NC_020537	TAC	2	6	750	755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470198177
5	NC_020537	GAA	2	6	757	762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470198177
6	NC_020537	TAA	2	6	777	782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470198177
7	NC_020537	ACA	2	6	805	810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470198177
8	NC_020537	AAC	2	6	825	830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470198177
9	NC_020537	AG	3	6	853	858	50 %	0 %	50 %	0 %	470198177
10	NC_020537	GCA	2	6	922	927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470198177
11	NC_020537	ATT	2	6	969	974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198177
12	NC_020537	GGTT	2	8	987	994	0 %	50 %	50 %	0 %	470198177
13	NC_020537	ATGC	2	8	1012	1019	25 %	25 %	25 %	25 %	470198177
14	NC_020537	TCA	2	6	1026	1031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470198177
15	NC_020537	ATA	2	6	1040	1045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470198177
16	NC_020537	TTA	2	6	1097	1102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198177
17	NC_020537	TTA	2	6	1162	1167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198177
18	NC_020537	GAT	2	6	1171	1176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470198177
19	NC_020537	AAG	2	6	1208	1213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470198177
20	NC_020537	ACC	2	6	1278	1283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470198177
21	NC_020537	AGA	2	6	1302	1307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470198177
22	NC_020537	TTG	2	6	1340	1345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470198177
23	NC_020537	CCA	2	6	1354	1359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470198177
24	NC_020537	AGA	2	6	1388	1393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470198177
25	NC_020537	GAA	3	9	1399	1407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470198177
26	NC_020537	CCA	2	6	1420	1425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470198177
27	NC_020537	TA	3	6	1438	1443	50 %	50 %	0 %	0 %	470198177
28	NC_020537	CAAAT	2	10	1445	1454	60 %	20 %	0 %	20 %	470198177
29	NC_020537	ATT	2	6	1512	1517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198177
30	NC_020537	CTG	2	6	1544	1549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470198177
31	NC_020537	A	6	6	1610	1615	100 %	0 %	0 %	0 %	470198177
32	NC_020537	A	7	7	1659	1665	100 %	0 %	0 %	0 %	470198177
33	NC_020537	AG	3	6	1714	1719	50 %	0 %	50 %	0 %	470198177
34	NC_020537	GAA	2	6	1750	1755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470198177
35	NC_020537	TGG	2	6	1758	1763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470198177
36	NC_020537	TCAT	2	8	1781	1788	25 %	50 %	0 %	25 %	470198177
37	NC_020537	A	6	6	1796	1801	100 %	0 %	0 %	0 %	470198177
38	NC_020537	AGA	2	6	1818	1823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470198177
39	NC_020537	AAG	2	6	1838	1843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470198177
40	NC_020537	TAAT	2	8	2150	2157	50 %	50 %	0 %	0 %	470198178
41	NC_020537	ATT	2	6	2181	2186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198178
42	NC_020537	TTA	2	6	2187	2192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198178
43	NC_020537	AAC	2	6	2230	2235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470198178
44	NC_020537	AGT	2	6	2380	2385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470198178
45	NC_020537	TTG	2	6	2403	2408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470198178
46	NC_020537	A	7	7	2416	2422	100 %	0 %	0 %	0 %	470198178
47	NC_020537	ATTA	2	8	2470	2477	50 %	50 %	0 %	0 %	470198178
48	NC_020537	AATTT	2	10	2493	2502	40 %	60 %	0 %	0 %	470198178
49	NC_020537	TTA	2	6	2531	2536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198178
50	NC_020537	CAATT	2	10	2559	2568	40 %	40 %	0 %	20 %	470198178
51	NC_020537	GACT	2	8	2692	2699	25 %	25 %	25 %	25 %	470198178
52	NC_020537	AGA	2	6	2731	2736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470198178
53	NC_020537	TCA	2	6	2757	2762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470198178
54	NC_020537	TAAA	2	8	2787	2794	75 %	25 %	0 %	0 %	470198178
55	NC_020537	GAA	2	6	2810	2815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470198178
56	NC_020537	TCT	2	6	2826	2831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470198178
57	NC_020537	TTTA	2	8	2848	2855	25 %	75 %	0 %	0 %	470198178
58	NC_020537	ATT	2	6	2884	2889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198178
59	NC_020537	ACA	2	6	2909	2914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470198178
60	NC_020537	AAATT	2	10	2937	2946	60 %	40 %	0 %	0 %	470198178
61	NC_020537	TTA	2	6	2993	2998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198178
62	NC_020537	GGT	2	6	3008	3013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470198178
63	NC_020537	TTA	2	6	3021	3026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198178
64	NC_020537	TGA	2	6	3040	3045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470198178
65	NC_020537	GTT	2	6	3047	3052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470198178
66	NC_020537	TCT	2	6	3059	3064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470198178
67	NC_020537	AGA	2	6	3091	3096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470198178
68	NC_020537	GGT	2	6	3119	3124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470198178
69	NC_020537	TTCA	2	8	3136	3143	25 %	50 %	0 %	25 %	470198178
70	NC_020537	AT	3	6	3151	3156	50 %	50 %	0 %	0 %	470198178
71	NC_020537	GATG	2	8	3157	3164	25 %	25 %	50 %	0 %	470198178
72	NC_020537	ATG	2	6	3183	3188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470198178
73	NC_020537	GTTGAA	2	12	3191	3202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470198178
74	NC_020537	TTC	2	6	3203	3208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470198178
75	NC_020537	GAC	2	6	3245	3250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470198178
76	NC_020537	AATT	2	8	3261	3268	50 %	50 %	0 %	0 %	470198178
77	NC_020537	ATG	2	6	3952	3957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470198179
78	NC_020537	A	6	6	4176	4181	100 %	0 %	0 %	0 %	470198179
79	NC_020537	GTC	2	6	4216	4221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470198179
80	NC_020537	AT	3	6	4229	4234	50 %	50 %	0 %	0 %	470198179
81	NC_020537	AGA	2	6	4265	4270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470198179
82	NC_020537	CTC	2	6	4291	4296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470198179
83	NC_020537	GAC	2	6	4303	4308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470198179
84	NC_020537	CTG	2	6	4339	4344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470198179
85	NC_020537	AAT	2	6	4392	4397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470198179
86	NC_020537	A	7	7	4423	4429	100 %	0 %	0 %	0 %	470198179
87	NC_020537	CAG	2	6	4458	4463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470198179
88	NC_020537	AAG	2	6	4564	4569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470198179
89	NC_020537	ATT	2	6	4582	4587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198179
90	NC_020537	GAA	2	6	4635	4640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470198179
91	NC_020537	ATA	2	6	4660	4665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470198179
92	NC_020537	GAT	2	6	4713	4718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470198179
93	NC_020537	TTA	3	9	4848	4856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198179
94	NC_020537	GAT	2	6	4878	4883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470198179
95	NC_020537	TTA	2	6	4899	4904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198179
96	NC_020537	ACA	2	6	5059	5064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470198180
97	NC_020537	GTAT	2	8	5131	5138	25 %	50 %	25 %	0 %	470198180
98	NC_020537	AG	4	8	5153	5160	50 %	0 %	50 %	0 %	470198180
99	NC_020537	ATA	2	6	5191	5196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470198180
100	NC_020537	GTT	2	6	5238	5243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470198180
101	NC_020537	A	6	6	5308	5313	100 %	0 %	0 %	0 %	470198180
102	NC_020537	TGG	2	6	5357	5362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470198180
103	NC_020537	CGG	2	6	5369	5374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470198180
104	NC_020537	TGG	2	6	5393	5398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470198180
105	NC_020537	TCA	2	6	5415	5420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470198180
106	NC_020537	TA	3	6	5474	5479	50 %	50 %	0 %	0 %	470198180
107	NC_020537	TCA	2	6	5480	5485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470198180
108	NC_020537	A	6	6	5493	5498	100 %	0 %	0 %	0 %	470198180
109	NC_020537	AAG	2	6	5521	5526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470198180
110	NC_020537	CAG	2	6	5619	5624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470198180
111	NC_020537	AG	3	6	5631	5636	50 %	0 %	50 %	0 %	470198180
112	NC_020537	TGA	2	6	5684	5689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470198180
113	NC_020537	AGA	2	6	5702	5707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470198180
114	NC_020537	ATG	2	6	5776	5781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470198180
115	NC_020537	TCA	2	6	5795	5800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470198180
116	NC_020537	GAT	2	6	5808	5813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470198180
117	NC_020537	GGT	2	6	5898	5903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470198180
118	NC_020537	AGA	2	6	5978	5983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470198180
119	NC_020537	TATC	2	8	6034	6041	25 %	50 %	0 %	25 %	470198180
120	NC_020537	ATT	2	6	6119	6124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198180
121	NC_020537	TAT	2	6	6191	6196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198180
122	NC_020537	GGC	2	6	6197	6202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470198180
123	NC_020537	TGC	2	6	6215	6220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470198180
124	NC_020537	A	6	6	6222	6227	100 %	0 %	0 %	0 %	470198180
125	NC_020537	CGT	2	6	6243	6248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470198180
126	NC_020537	GAA	2	6	6312	6317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470198180
127	NC_020537	G	6	6	6351	6356	0 %	0 %	100 %	0 %	470198180
128	NC_020537	TAGA	2	8	6439	6446	50 %	25 %	25 %	0 %	470198180
129	NC_020537	TGGA	2	8	6565	6572	25 %	25 %	50 %	0 %	470198180
130	NC_020537	TTA	2	6	6591	6596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198180
131	NC_020537	TTC	2	6	6600	6605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470198180
132	NC_020537	TAT	2	6	6693	6698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198180
133	NC_020537	TGAAT	2	10	6734	6743	40 %	40 %	20 %	0 %	470198180
134	NC_020537	AATG	2	8	6788	6795	50 %	25 %	25 %	0 %	470198180
135	NC_020537	ACA	2	6	6813	6818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470198180
136	NC_020537	AGA	2	6	6932	6937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470198180
137	NC_020537	TCAA	2	8	7019	7026	50 %	25 %	0 %	25 %	470198181
138	NC_020537	TCG	2	6	7142	7147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470198181
139	NC_020537	A	6	6	7197	7202	100 %	0 %	0 %	0 %	470198181
140	NC_020537	GTTATC	2	12	7297	7308	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470198181
141	NC_020537	TTG	2	6	7312	7317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470198181
142	NC_020537	ATGG	2	8	7341	7348	25 %	25 %	50 %	0 %	470198181
143	NC_020537	GCA	3	9	7356	7364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470198181
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147	NC_020537	GGTA	2	8	7532	7539	25 %	25 %	50 %	0 %	470198181
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149	NC_020537	TAAG	2	8	7597	7604	50 %	25 %	25 %	0 %	470198181
150	NC_020537	GGA	2	6	7634	7639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470198181
151	NC_020537	CTG	2	6	7663	7668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470198181
152	NC_020537	TTCAA	2	10	7721	7730	40 %	40 %	0 %	20 %	470198181
153	NC_020537	GAA	2	6	7752	7757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470198181
154	NC_020537	TTG	2	6	7780	7785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470198181
155	NC_020537	A	6	6	7828	7833	100 %	0 %	0 %	0 %	470198181
156	NC_020537	TCGT	2	8	7843	7850	0 %	50 %	25 %	25 %	470198181
157	NC_020537	TGA	2	6	7883	7888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470198181
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159	NC_020537	CAT	2	6	7990	7995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470198181
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162	NC_020537	ATT	2	6	8065	8070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198181
163	NC_020537	GTT	2	6	8088	8093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470198181
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165	NC_020537	ATT	2	6	8184	8189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198181
166	NC_020537	CAGATA	2	12	8206	8217	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470198181
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168	NC_020537	CAAGCT	2	12	8265	8276	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470198181
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170	NC_020537	TTA	2	6	8346	8351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198181
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174	NC_020537	TGA	2	6	8447	8452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470198181
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239	NC_020537	CAA	2	6	11305	11310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470198183
240	NC_020537	CT	3	6	11313	11318	0 %	50 %	0 %	50 %	470198183
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244	NC_020537	AGA	2	6	11532	11537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470198183
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248	NC_020537	CGTTG	2	10	11735	11744	0 %	40 %	40 %	20 %	470198183
249	NC_020537	AATG	2	8	11811	11818	50 %	25 %	25 %	0 %	470198183
250	NC_020537	GGT	2	6	11875	11880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470198183
251	NC_020537	ATC	2	6	11915	11920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470198183
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253	NC_020537	GAT	2	6	12045	12050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470198183
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255	NC_020537	AAG	2	6	12140	12145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470198183
256	NC_020537	GCT	2	6	12169	12174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470198183
257	NC_020537	ATT	2	6	12190	12195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198183
258	NC_020537	GT	3	6	12209	12214	0 %	50 %	50 %	0 %	470198183
259	NC_020537	AGC	2	6	12243	12248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470198183
260	NC_020537	CGT	2	6	12286	12291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470198183
261	NC_020537	GAG	2	6	12298	12303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470198183
262	NC_020537	CCAT	2	8	12319	12326	25 %	25 %	0 %	50 %	470198183
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264	NC_020537	ATT	2	6	12807	12812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470198184
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